Tại Lễ bốc thăm của Giải bóng đá Thanh Niên sinh viên quốc tế 2025 - cúp THACO, hai đại diện Việt Nam được chia vào 2 bảng. Chủ nhà Giải bóng đá Thanh Niên sinh viên quốc tế 2025 - cúp THACO có mã số A1, còn Trường ĐH VH-TT-DL Thanh Hóa có mã số B3. Cũng vì vậy, 2 đại diện Việt Nam sẽ thi đấu lệch ngày để ngày nào cũng đều có đội của Việt Nam tranh tài ở vòng bảng của Giải bóng đá Thanh Niên sinh viên quốc tế 2025 - cúp THACO.

Những lá thăm ngẫu nhiên đã đưa chủ nhà Trường ĐH Tôn Đức Thắng vào chung bảng A với 2 đội bóng láng giềng sát vách Việt Nam là Trường ĐH Life (Campuchia) và Trường ĐH Lào. Bảng B có nhà đương kim vô địch Việt Nam là Trường ĐH VH-TT-DL Thanh Hóa cùng 2 đại diện quốc tế còn lại là Trường ĐH Công nghệ Nanyang (Singapore) và Trường ĐH Malaysia.

Tại Giải bóng đá Thanh Niên sinh viên quốc tế 2025 - cúp THACO, 06 đội bóng chia làm 2 bảng thi đấu vòng tròn một  lượt để tính điểm, xếp hạng. Đội xếp thứ nhất và đội xếp thứ nhì mỗi bảng sẽ thi  đấu trận bán kết, hai đội thắng bán kết sẽ thi đấu trận chung kết, hai đội thua bán  kết tranh hạng ba. 

Đội vô địch nhận Cúp, huy chương, bảng danh vị và giải thưởng 6.000 USD. Đội thứ Nhì nhận bảng danh vị và giải thưởng 4.000 USD. Đội thứ Ba nhận bảng danh vị và giải thưởng 2.000 USD. Giải phong cách bao gồm Bảng danh vị và giải thưởng 1.500 USD. Cầu thủ ghi nhiều bàn thắng nhất nhận 500 USD. Nếu trường hợp có 2 cầu thủ trở lên ghi được số bàn thắng cao nhất bằng nhau, các cầu thủ đó đều được công nhận là cầu thủ ghi nhiều bàn thắng nhất và giải thưởng sẽ được chia đều cho các cầu thủ đó. Ngoài ra, Cầu thủ xuất sắc nhất nhận 500 USD. Thủ môn xuất sắc nhất nhận 500 USD.Tổ trọng tài xuất sắc nhận 500 USD. Cầu thủ xuất sắc từng trận nhận 100 USD/trận.